Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP2C9P11712 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP2C9P11712 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP2C9P11712 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms