Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPCP11686 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFTPCP11686 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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