Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1P11387 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1P11387 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1P11387 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1P11387 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1P11387 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1P11387 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1P11387 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1P11387 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1P11387 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1P11387 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1P11387 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1P11387 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1P11387 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1P11387 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1P11387 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1P11387 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1P11387 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1P11387 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1P11387 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1P11387 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1P11387 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1P11387 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1P11387 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1P11387 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1P11387 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1P11387 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOP1P11387 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TOP1P11387 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1P11387 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1P11387 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1P11387 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1P11387 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1P11387 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1P11387 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1P11387 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1P11387 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms