Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBP11277 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBP11277 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBP11277 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBP11277 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBP11277 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBP11277 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBP11277 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBP11277 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBP11277 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBP11277 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBP11277 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBP11277 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBP11277 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBP11277 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBP11277 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBP11277 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBP11277 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBP11277 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBP11277 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBP11277 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBP11277 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBP11277 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBP11277 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBP11277 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBP11277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBP11277 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBP11277 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBP11277 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBP11277 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms