Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPP1P10451 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPP1P10451 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPP1P10451 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPP1P10451 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPP1P10451 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPP1P10451 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPP1P10451 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms