Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C8orf88P0DMB2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf88P0DMB2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms