Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGA4P0DJD7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGA4P0DJD7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGA4P0DJD7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms