Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC166P0CW27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms