Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2MP0CAP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR2MP0CAP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms