Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L7P0C7H9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L7P0C7H9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms