Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
C4AP0C0L4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
C4AP0C0L4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C4AP0C0L4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
C4AP0C0L4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms