Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDGFRBP09619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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