Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPSAP08865 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPSAP08865 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPSAP08865 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPSAP08865 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPSAP08865 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPSAP08865 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPSAP08865 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPSAP08865 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPSAP08865 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPSAP08865 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPSAP08865 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPSAP08865 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPSAP08865 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPSAP08865 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPSAP08865 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPSAP08865 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPSAP08865 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPSAP08865 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPSAP08865 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPSAP08865 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPSAP08865 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms