Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLK3P07288 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLK3P07288 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLK3P07288 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLK3P07288 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLK3P07288 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLK3P07288 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLK3P07288 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLK3P07288 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLK3P07288 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLK3P07288 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLK3P07288 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLK3P07288 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLK3P07288 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLK3P07288 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms