Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGHV3-33P01772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms