Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA2P01563 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA2P01563 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms