Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
F13A1P00488 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F13A1P00488 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
F13A1P00488 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
F13A1P00488 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F13A1P00488 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
F13A1P00488 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
F13A1P00488 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
F13A1P00488 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
F13A1P00488 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
F13A1P00488 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
F13A1P00488 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
F13A1P00488 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
F13A1P00488 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F13A1P00488 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F13A1P00488 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
F13A1P00488 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F13A1P00488 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
F13A1P00488 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
F13A1P00488 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
F13A1P00488 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
F13A1P00488 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms