Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN13O95857 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms