Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC2O95714 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC2O95714 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC2O95714 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC2O95714 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC2O95714 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC2O95714 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC2O95714 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC2O95714 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC2O95714 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC2O95714 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC2O95714 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HERC2O95714 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC2O95714 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC2O95714 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERC2O95714 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC2O95714 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERC2O95714 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC2O95714 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HERC2O95714 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC2O95714 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC2O95714 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC2O95714 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC2O95714 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC2O95714 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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