Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP4O95707 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POP4O95707 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POP4O95707 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POP4O95707 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP4O95707 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP4O95707 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POP4O95707 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POP4O95707 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POP4O95707 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP4O95707 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP4O95707 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP4O95707 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POP4O95707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP4O95707 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP4O95707 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP4O95707 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP4O95707 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP4O95707 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP4O95707 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP4O95707 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP4O95707 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP4O95707 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP4O95707 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP4O95707 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP4O95707 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP4O95707 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP4O95707 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP4O95707 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP4O95707 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP4O95707 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP4O95707 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP4O95707 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP4O95707 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms