Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABARAPO95166 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms