Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNUPNO95149 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNUPNO95149 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNUPNO95149 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms