Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL5O76039 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDKL5O76039 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL5O76039 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms