Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM3O75607 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM3O75607 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM3O75607 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM3O75607 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM3O75607 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM3O75607 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM3O75607 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM3O75607 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM3O75607 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM3O75607 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM3O75607 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM3O75607 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM3O75607 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM3O75607 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM3O75607 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM3O75607 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM3O75607 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM3O75607 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM3O75607 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPM3O75607 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPM3O75607 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPM3O75607 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NPM3O75607 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPM3O75607 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPM3O75607 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPM3O75607 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NPM3O75607 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms