Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCATO75600 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCATO75600 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCATO75600 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCATO75600 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCATO75600 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCATO75600 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCATO75600 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCATO75600 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCATO75600 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCATO75600 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCATO75600 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCATO75600 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCATO75600 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCATO75600 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCATO75600 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCATO75600 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCATO75600 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCATO75600 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCATO75600 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCATO75600 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCATO75600 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCATO75600 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCATO75600 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCATO75600 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCATO75600 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCATO75600 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms