Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA4O75335 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA4O75335 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms