Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GADD45BO75293 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GADD45BO75293 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms