Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DTNBO60941 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DTNBO60941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DTNBO60941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DTNBO60941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTNBO60941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTNBO60941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DTNBO60941 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DTNBO60941 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DTNBO60941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTNBO60941 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTNBO60941 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTNBO60941 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DTNBO60941 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DTNBO60941 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DTNBO60941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DTNBO60941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DTNBO60941 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DTNBO60941 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DTNBO60941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTNBO60941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTNBO60941 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTNBO60941 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTNBO60941 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTNBO60941 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTNBO60941 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DTNBO60941 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DTNBO60941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DTNBO60941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DTNBO60941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms