Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOL3O60936 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOL3O60936 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOL3O60936 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOL3O60936 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOL3O60936 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOL3O60936 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOL3O60936 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOL3O60936 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOL3O60936 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOL3O60936 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOL3O60936 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOL3O60936 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOL3O60936 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOL3O60936 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOL3O60936 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOL3O60936 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOL3O60936 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOL3O60936 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms