Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF2O60811 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF2O60811 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms