Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
ATP8B3O60423 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms