Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG3O60359 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG3O60359 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms