Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD5O60279 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD5O60279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms