Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLIN1O60240 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PLIN1O60240 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PLIN1O60240 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PLIN1O60240 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms