Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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