Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX1O43933 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX1O43933 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX1O43933 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX1O43933 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX1O43933 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX1O43933 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX1O43933 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX1O43933 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX1O43933 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX1O43933 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX1O43933 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX1O43933 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX1O43933 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX1O43933 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX1O43933 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX1O43933 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX1O43933 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX1O43933 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX1O43933 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX1O43933 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX1O43933 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX1O43933 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX1O43933 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX1O43933 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX1O43933 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX1O43933 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms