Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRICKLE3O43900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms