Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
C21orf2O43822 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C21orf2O43822 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C21orf2O43822 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C21orf2O43822 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C21orf2O43822 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C21orf2O43822 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms