Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRC1O43663 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRC1O43663 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRC1O43663 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRC1O43663 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRC1O43663 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRC1O43663 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRC1O43663 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRC1O43663 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRC1O43663 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRC1O43663 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRC1O43663 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRC1O43663 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRC1O43663 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRC1O43663 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRC1O43663 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRC1O43663 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRC1O43663 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRC1O43663 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRC1O43663 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRC1O43663 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRC1O43663 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRC1O43663 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRC1O43663 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRC1O43663 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms