Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF13O43567 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF13O43567 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF13O43567 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF13O43567 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF13O43567 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF13O43567 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF13O43567 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF13O43567 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF13O43567 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF13O43567 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF13O43567 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms