Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMTOR5O43504 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMTOR5O43504 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMTOR5O43504 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms