Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1GO43497 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms