Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX1O43435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX1O43435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX1O43435 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX1O43435 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBX1O43435 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBX1O43435 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBX1O43435 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBX1O43435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBX1O43435 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBX1O43435 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBX1O43435 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBX1O43435 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms