Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERI3O43414 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERI3O43414 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERI3O43414 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERI3O43414 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERI3O43414 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERI3O43414 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERI3O43414 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERI3O43414 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERI3O43414 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERI3O43414 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERI3O43414 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERI3O43414 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERI3O43414 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERI3O43414 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERI3O43414 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERI3O43414 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERI3O43414 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERI3O43414 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERI3O43414 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERI3O43414 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERI3O43414 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI3O43414 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI3O43414 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI3O43414 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI3O43414 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI3O43414 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms