Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SART1O43290 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SART1O43290 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SART1O43290 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SART1O43290 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SART1O43290 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SART1O43290 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SART1O43290 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SART1O43290 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SART1O43290 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SART1O43290 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SART1O43290 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SART1O43290 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SART1O43290 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SART1O43290 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SART1O43290 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SART1O43290 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SART1O43290 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SART1O43290 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SART1O43290 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SART1O43290 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SART1O43290 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SART1O43290 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SART1O43290 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SART1O43290 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms