Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms