Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YKT6O15498 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YKT6O15498 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YKT6O15498 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YKT6O15498 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YKT6O15498 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YKT6O15498 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YKT6O15498 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YKT6O15498 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YKT6O15498 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YKT6O15498 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YKT6O15498 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YKT6O15498 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YKT6O15498 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YKT6O15498 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YKT6O15498 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YKT6O15498 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YKT6O15498 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YKT6O15498 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YKT6O15498 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YKT6O15498 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YKT6O15498 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YKT6O15498 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YKT6O15498 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YKT6O15498 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YKT6O15498 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YKT6O15498 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YKT6O15498 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YKT6O15498 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YKT6O15498 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YKT6O15498 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YKT6O15498 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YKT6O15498 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YKT6O15498 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YKT6O15498 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms