Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VGFO15240 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VGFO15240 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VGFO15240 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VGFO15240 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VGFO15240 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VGFO15240 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VGFO15240 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
VGFO15240 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VGFO15240 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
VGFO15240 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
VGFO15240 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
VGFO15240 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
VGFO15240 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
VGFO15240 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VGFO15240 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
VGFO15240 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
VGFO15240 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VGFO15240 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VGFO15240 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VGFO15240 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VGFO15240 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VGFO15240 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VGFO15240 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
VGFO15240 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VGFO15240 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VGFO15240 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VGFO15240 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VGFO15240 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VGFO15240 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VGFO15240 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VGFO15240 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
VGFO15240 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGFO15240 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VGFO15240 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VGFO15240 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VGFO15240 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VGFO15240 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VGFO15240 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VGFO15240 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VGFO15240 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VGFO15240 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGFO15240 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VGFO15240 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VGFO15240 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VGFO15240 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VGFO15240 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VGFO15240 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VGFO15240 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VGFO15240 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VGFO15240 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VGFO15240 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VGFO15240 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGFO15240 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGFO15240 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGFO15240 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGFO15240 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VGFO15240 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VGFO15240 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGFO15240 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGFO15240 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGFO15240 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGFO15240 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGFO15240 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGFO15240 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGFO15240 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGFO15240 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGFO15240 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
VGFO15240 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
VGFO15240 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
VGFO15240 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VGFO15240 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms