Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC1BO15143 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms