Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNPHO15079 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNPHO15079 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNPHO15079 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNPHO15079 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNPHO15079 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNPHO15079 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNPHO15079 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNPHO15079 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNPHO15079 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNPHO15079 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNPHO15079 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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